一、个人简介

黄原，教授，博士生导师，1980年进入陕西师范大学生物学学习，1990获得动物学专业博士学位；1992-1994年在西北农业大学植保系从事分子系统学博士后研究；1996-1998年美国内布拉斯加大学做访问学者和博士后研究，从事昆虫分子系统学与进化生物学研究；2004年2-8月在加拿大蒙特利尔大学生物化学系从事基因组学和生物信息学研究；2015年3-9月在英国伦敦自然历史博物馆进行基于第二代测序技术的高通量生物多样性检测和生物信息学研究。研究方向主要集中在昆虫和鸟类的分子进化和分子系统学、基因组学等方面。教学方面为本科生讲授生物信息学、分子生物学、普通动物学等课程，为研究生开设动物学研究方法、基因组学、分子进化和分子系统学、生物信息学和整合动物学等课程。主持完成国家自然科学基金项目9项，获得陕西省科学技术奖二等奖两次，在国内外生物学期刊发表论文200余篇，出版专著3部。现为中国昆虫学会直翅类昆虫专业委员会副主任，《昆虫分类学报》编委。

二、主要研究领域及兴趣

黄原教授的《分子进化生物学实验室》主要从事分子进化和分子系统学研究，包括利用高通量测序技术获得的基因组和转录组数据研究直翅目昆虫和鸟类主要类群的时空演化模式和系统发育关系，直翅目昆虫基因组大小与重复序列的演化动态，直翅目线粒体基因组学研究等。

三、承担的科研项目

1.主持国家自然科学基金面上项目，蝗亚目昆虫重复序列组成的多样性和演化动态，2024.01.01-2027.12.31，项目批号32370474。

2.主持国家自然科学基金面上项目，蝗亚目昆虫基因组大小的变异和进化，2019.01.01-2022.12.31，项目批号31872217。

3.主持国家自然科学基金面上项目，基于转录组数据的直翅目昆虫谱系基因组学研究，2014.1.1-2017.12.31，项目批号31372192。

4.主持国家自然科学基金面上项目，直翅目昆虫的比较及进化线粒体转录组学研究，2012.1.1-2015.12.31，项目批准号31172076。

5.主持国家自然科学基金面上项目，直翅目昆虫线粒体基因组的进化型式和速率以及与飞行能力和生态型关系的研究，2010.1.1-2012.12.31，项目批准号30970346。

6.主持国家自然科学基金面上项目，多新翅类昆虫的线粒体谱系基因组学研究，2007.1.1-2009.12.31，项目批准号30670279。

7.主持国家自然科学基金面上项目，直翅目昆虫的比较及进化线粒体基因组学，2005.1.1-2007.12.31，项目批准号30470238。

8.主持国家自然科学基金面上项目，昆虫葡萄糖6磷酸脱氢酶基因结构和序列进化的比较研究，2001.1.1-2003.12.31，项目批准号3007011416。

9.主持国家自然科学基金面上项目，直翅目昆虫mtDNA的分子系统学研究，1995.1.1-1998.12.31，项目批准号39570110。

10.主持教育部优秀青年教师基金，单拷贝核基因的分子系统学研究，1999.1.1-2002.12.31。

四、出版的著作

1.黄原，2012，分子系统发生学，科学出版社。

2. 黄原，卢慧甍，郑哲民，2004，中国蝗总科分类鉴定专家系统（ESCA），中国农业出版社。

3.黄原，1998，分子系统学：原理、方法及应用，中国农业出版社。

五、代表性论文

1.Xuejuan Li, Xiaoyang Wang, Chao Yang, Liliang Lin, Hao Yuan, Fumin Lei and Yuan Huang*, A de novo assembled genome of the Tibetan Partridge (Perdix hodgsoniae) and its high-altitude adaptation. Integrative Zoology, 2023, 18: 225–236.

2. Kuo Sun, Yingchun Lu, Yuan Huang*, Huateng Huang*, Genome size evolution in grasshoppers (Orthoptera: Caelifera: Acrididae). Systematic Entomology, 2023, 48:434–444.

3. Xuanzeng Liu, Muhammad Majid, Hao Yuan, Huihui Chang, Lina Zhao, Yimeng Nie, Lang He, Xiaojing Liu, Xiaoting He and Yuan Huang*. Transposable element expansion and low-level piRNA silencing in grasshoppers may cause genome gigantism. BMC Biology, 2022, 20:243.

4.Xiaolei Feng, Nan Yang, Qilu Wang, Hao Yuan, Xuejuan Li, Muhammad Majid, Xue Zhang, Chengquan Cao*, Yuan Huang*, A Chromosome-Level Genome Assembly of the Pygmy Mole CricketXya riparia. Genome Biology and Evolution, 2022, 14(1): 001.

5.Huihui Chang, Xiaoqiang Guo, Shuli Guo, Nan Yang, Yuan Huang. Trade-off between flight capability and reproduction in Acridoidea (Insecta: Orthoptera). Ecology and Evolution. 2021, 11:16849–16861.

6.Huihui Chang, Yimeng Nie, Nan Zhang, Xue Zhang, Huimin Sun, Ying Mao, Zhongying Qiu, Yuan Huang*. MtOrt- an empirical mitochondrial amino acid substitution model for evolutionary studies of Orthoptera insects. BMC Evolutionary Biology, 2020, 57:1-15.

7.Huihui Chang, Zhongying Qiu, Hao Yuan, Xiaoyang Wang, Xuejuan Lia, Huimin Sun, Xiaoqiang Guo, Yingchun Lu, Xiaolei Feng, Muhammad Majid, Yuan Huang*. Evolutionary rates of and selective constraints on the mitochondrial genomes of Orthoptera insects with different wing types. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2020, 145:106734.

8.Hao Yuan, Huihui Chang, Lina Zhao, Chao Yang, and Yuan Huang*. Sex- and tissue-specific transcriptome analyses and expression profiling of olfactory-related genes inCeracris nigricornis Walker (Orthoptera: Acrididae). BMC Genomics, 2019, 20:808.

9.Zhongying Qiu, Fei Liu, Huimeng Lu and Yuan Huang. Characterization and analysis of a de novo transcriptome from the pygmy grasshopperTetrix japonica. Molecular Ecology Resources, 2017, 17(3): 381-392.

10.Hojun Song, Christiane Amedegnato, Maria Marta Ciglianod, Laure Desutter-Grandcolasc, Sam W. Heads, Yuan Huang(黄原), Daniel Otte, Michael F. Whiting. 300 million years of diversification: elucidating the patterns of orthopteran evolution based on comprehensive taxon and gene sampling. Cladistics, 2015, 31:621–651.

六、获奖情况

1.《直翅目昆虫和鸟类的线粒体基因组研究》，2018，陕西省科学技术奖二等奖，第一完成人。

2.《中国蝗虫的分子系统学和分类鉴定》，2010年，陕西省科学技术奖二等奖，第一完成人。